O Comitê Gestor é constituído de um coordenador geral e mais dois membros indicados pelas Sociedades Científicas Brasileiras envolvidas na criação do BrCAST: Sociedade Brasileira de Análises Clínicas (SBAC); Sociedade Brasileira de Infectologia (SBI); Sociedade Brasileira de Microbiologia (SBM) e Sociedade Brasileira de Patologia Clínica/Medicina Laboratorial (SBPC/ML). O coordenador geral é escolhido pelos membros indicados pelas Sociedades e tem um mandato de dois anos. Cada um dos membros do Comitê Gestor tem um mandato de dois anos, renovável por mais dois anos. A cada dois anos 50% dos membros são substituídos de modo a permitir ampla participação dos membros das diferentes sociedades. A composição para o período de maio de 2023 a abril 2025 é a seguinte:
